Полное имя актёра — Стивен Джон Фрай. Стивен Фрай — сын Марианны Фрай и физика-изобретателя Алана Фрая. Лучший друг Стивена — актер Хью Лори. Фрай является крестным отцом троих детей Лори.
Был гостем на свадьбе принца Чарльза и Камиллы Паркер-Боулз.

Фрай записал аудиокнигу "Гарри Поттер" [7 частей], а также аудиокнигу "Автостопом по галактике" и читает текст за кадром в одноименном фильме. Кроме того, Фрай говорит голосом рассказчика в первых 5-ти частях видеоигры о Гарри Поттере.
Стивен Фрай является открытым гомосексуалистом.
В 18 лет будущий актер на три месяца угодил в тюрьму за мошенничество с кредитной картой.
В 1984 году Фрай впервые добился известности, написав адаптированную версию мюзикла Ноэла Гея "Я и моя девушка"; поставленная на сцене лондонского театра "Adelphi", пьеса быстро завоевала успех и сделала 30-летнего Фрая достаточно обеспеченным человеком.