Скотт Уилсон родился и вырос в Атланте, штат Джорджия и переехал в Лос-Анджелес в 1961 году, когда ему было 19 лет. Он начал обучаться актёрской профессии и в 1967 году дебютировал на экране в фильме "Душной южной ночью". Тогда же он сыграл одну из главных ролей в фильме Ричарда Брукса "Хладнокровно", где сыграл роль Ричарда Хикока, убившего свою семью. Фильм стал успешен в прокате и карьера Уилсона пошла в гору, а 12 мая 1967 года он был изображен на обложке журнала Life, когда ему было только 24 года.

Уилсон появился в более шестидесяти фильмах на протяжении своей карьеры. Большую часть семидесятых он исполнял роли второго плана в таких фильмах как "Мотыльки на ветру", "Новые центурионы" и "Великий Гэтсби". Он получил номинацию на премию "Золотой глобус" в 1981 за роль в фильме "Девятая конфигурация" с Стейси Кич, а после снялся в таких картинах как "Парни что надо", "Мэлоун", "Красавчик Джонни", "Изгоняющий дьявола 3", "Молодые стрелки 2", "Чистое везение", "Джеронимо: Американская легенда", "Судья Дредд", "Мертвец идёт", "Солдат Джейн", "Пёрл-Харбор", "Монстр" и многих других. В 2007 году он получил специальную премию Гильдии киноактёров США.

В последние годы Уилсон был в первую очередь заметен на телевидении. Он сыграл роль отца героини Мардж Хелгенбергер в телесериале "C.S.I.: Место преступления" в период между 2001—2006 годами, а также был гостем в сериалах "Секретные материалы" и "Закон и порядок". В 2011 году он присоединился к актёрскому составу телесериала "Ходячие мертвецы" в роли Хершеля Грина. За свою роль он получил хорошие отзывы от критиков. Хотя изначально планировалось, что актёр покинет шоу в финале 2-го сезона, благодаря благоприятным отзывам критиков, продюсеры решили не убивать его героя и пригласили Уилсона в 3 сезон.

С 1977 года Скотт Уилсон женат на Харвенли Уилсон, у них нет детей.